银杏为雌雄异株植物，开花并结果的是雌株，只开花不结果的为雄株。雌株常比雄株矮小，但茎干较为粗壮。具体可从以下几方面辨别： 

 1. 分枝角度：雌株主枝与主干的夹角大，可达50°以上，枝条向四方展开，有时下垂，且横枝比雄株多而凌乱；雄株主枝与主干夹角小，大多在30°以内，枝条的尖削度小，有的几近平行于主干生长，枝条挺直，雄壮有力。 

 2. 冠形：雌株树冠形成早，圆头形，顶端平或稍有突起；雄株树冠形成较慢，顶端较尖削。 

 3. 叶片：雌株叶片普遍比雄株叶片小而色绿，叶裂刻较少而浅，缺刻未达叶中部；雄株叶片校雌株大而色淡，叶裂刻较深，缺刻超过叶中部，且叶脉较粗。

 4. 雌雄花：银杏的花是单性花，每个雌花在叶腋内单生，很不明显，外行看了很像一段叶柄；雄花大而明显，呈葇荑花序状，多而松散。但要特别说明的是，银杏为裸子植物，其实没有真正的花。通常所说的雌花实际上是它的大孢子叶球，雄花是它的小孢子叶球。区分二者是辨别雌雄株最准确的方法。 5. 萌发和落叶时间。雌株早春发芽较雄株晚，但秋后叶变黄及落叶期较雄株早。